Durante a Batalha da Grã-Bretanha, os alemães Luftwaffe lança um pesado ataque aéreo noturno em Londres. A cúpula da catedral de São Paulo foi perfurada por uma bomba nazista, deixando o altar alto em ruínas. Foi uma das poucas ocasiões em que a catedral do século XVII sofreu danos significativos durante os bombardeios quase incessantes da Alemanha sobre Londres no outono de 1940.
Segundo a tradição, um templo romano da deusa Diana já esteve em Ludgate Hill, no local da Catedral de São Paulo. Em 604 d.C., o rei Aethelberht dediquei a primeira catedral cristã a São Paulo. Aquela catedral queimou e sua substituição foi destruída pelos vikings em 962. Uma terceira catedral foi destruída por um incêndio em 1087 e foi substituída por uma grande estrutura normanda que foi concluída no século XIII. No século XVI, a quarta catedral caiu em desuso e foi danificada pelo fogo, e mais danos foram causados durante as guerras civis inglesas do século XVII. Na década de 1660, o arquiteto inglês Sir Christopher Wren foi alistado para reparar a catedral, mas o Grande Incêndio de Londres interveio, destruindo a Catedral de Old St. Paul em 1666.
Após o incêndio, Wren projetou uma nova Catedral de São Paulo, com dezenas de novas igrejas menores à sua volta, como satélites. A catedral era a obra-prima de Wren, com um design barroco e uma cúpula proeminente e imponente. O próprio Wren estabeleceu o bloco de fundação em 1675 e em 1710 colocou a pedra final no lugar. Quando o arquiteto morreu em 1723, ele foi enterrado com grande cerimônia em São Paulo. Uma inscrição perto de sua tumba diz: Lector, si monumentum requiris, circumspice'Latim para "Reader, se você procurar um monumento, olhe a seu respeito." Muitos outros cidadãos britânicos notáveis mais tarde se juntaram a ele nas criptas de São Paulo, incluindo os heróis militares Lord Nelson e o duque de Wellington.
A Catedral de São Paulo tornou-se uma inspiração para o povo britânico durante a Segunda Guerra Mundial. Na Batalha da Grã-Bretanha, a Luftwaffe tentou bombardear a Grã-Bretanha, atingindo Londres e outras grandes cidades, mas São Paulo escapou milagrosamente de grandes danos causados por bombas, mesmo quando os edifícios históricos nas proximidades foram reduzidos a escombros. Imagens de São Paulo emolduradas por fumaça e fogo tornaram-se um símbolo do espírito indomável da Grã-Bretanha. As brigadas civis de defesa, incluindo o St. Paul's Fire Watch, protegeram a estrutura do fogo e, a certa altura, uma bomba não explodida foi removida com grande risco do telhado da catedral. Apesar dos danos causados na noite de 9 de outubro de 1940, a catedral sobreviveu ao Blitz em grande parte intacta. Em 1944, os sinos de São Paulo tocaram para celebrar a libertação de Paris, e em 1945 os cultos que marcaram o fim da guerra na Europa foram assistidos por 35.000 pessoas.